RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626874.2

CHD2-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CHD2, Length 7,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-208	ENST00000626874	CCL15	Q16663	113 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	LRRC24	Q50LG9	513 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	BSND	Q8WZ55	320 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	AHSP	Q9NZD4	102 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MAP10	Q9P2G4	905 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PTPRT	O14522	1441 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	RASA4B	C9J798	803 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	RASA4	O43374	803 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ANXA9	O76027	345 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ADORA2B	P29275	332 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	LIG3	P49916	1009 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	HUNK	P57058	714 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SLC9A5	Q14940	896 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	STYK1	Q6J9G0	422 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	FAM187A	A6NFU0	413 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	WDR47	O94967	919 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DAB2	P98082	770 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	STX5	Q13190	355 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SNF8	Q96H20	258 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ZBTB7A	O95365	584 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ATP6V1C1	P21283	382 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	OR1G1	P47890	313 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	EPHA7	Q15375	998 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SARM1	Q6SZW1	724 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	OLFM3	Q96PB7	478 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	TESK2	Q96S53	571 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	LXN	Q9BS40	222 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CD209	Q9NNX6	404 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	RXRG	P48443	463 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CENPA	P49450	140 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MAP4K1	Q92918	833 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PTPRN2	Q92932	1015 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ADGRL2	O95490	1459 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DIAPH2	O60879	1101 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CDH6	P55285	790 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	POTEA	Q6S8J7	498 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	STMN3	Q9NZ72	180 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PJA2	O43164	708 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ENTPD3	O75355	529 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	FAM200B	P0CF97	657 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DEFA1	P59665	94 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DEFA3	P59666	94 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CENPC	Q03188	943 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SCRN1	Q12765	414 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	TCEA2	Q15560	299 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CES5A	Q6NT32	575 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PID1	Q7Z2X4	250 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MROH8	Q9H579	483 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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