RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, human

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OPN3-204	ENST00000469376	ARID2	Q68CP9	1835 aa		27.57	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	DGAT1	O75907	488 aa		27.57	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	SLCO1A2	P46721	670 aa		27.57	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		27.57	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		27.57	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	DCLK3	Q9C098	648 aa		27.57	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	AAAS	Q9NRG9	546 aa		27.57	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	MYPN	Q86TC9	1320 aa		27.56	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	TP73	O15350	636 aa		27.56	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	CLDN10	P78369	228 aa		27.56	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		27.56	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		27.56	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		27.56	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		27.56	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		27.56	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	KIF3C	O14782	793 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	STBD1	O95210	358 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	GSTA1	P08263	222 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	GJA5	P36382	358 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	XRCC4	Q13426	336 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	IFT74	Q96LB3	600 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	EXTL3	O43909	919 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	SORBS3	O60504	671 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	IVD	P26440	423 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	WDR44	Q5JSH3	913 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ATL2	Q8NHH9	583 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	BICD1	Q96G01	975 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	CHST7	Q9NS84	486 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	PTPRF	P10586	1907 aa		27.55	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	CHUK	O15111	745 aa		27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ZNF862	O60290	1169 aa		27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	PSAP	P07602	524 aa		27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	SNX1	Q13596	522 aa		27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	PSMD6	Q15008	389 aa		27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	TREML2	Q5T2D2	321 aa		27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	BBOF1	Q8ND07	529 aa		27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		27.54	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	PSTPIP1	O43586	416 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	TCEA3	O75764	348 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	PROSC	O94903	275 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	TTC4	O95801	387 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ATF2	P15336	505 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	RRM1	P23921	792 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	LIN9	Q5TKA1	542 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	FUK	Q8N0W3	1084 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	DSG3	P32926	999 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ATG4C	Q96DT6	458 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	SGSM3	Q96HU1	749 aa		27.53	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	NR3C2	P08235	984 aa		27.52	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ITGA8	P53708	1063 aa		27.52	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	LONRF1	Q17RB8	773 aa		27.52	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ZACN	Q401N2	412 aa		27.52	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	MON1B	Q7L1V2	547 aa		27.52	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ZNF516	Q92618	1163 aa		27.52	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	RNF146	Q9NTX7	359 aa		27.52	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	NFASC	O94856	1347 aa		27.52	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	VWA5A	O00534	786 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ACSL3	O95573	720 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	KCNA2	P16389	499 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	SOX10	P56693	466 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	SNAPC2	Q13487	334 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	KCNN1	Q92952	543 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	WNK4	Q96J92	1243 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		27.51	■■■□□ 2
OPN3-204	ENST00000469376	WDR81	Q562E7	1941 aa		27.51	■■□□□ 1.99
OPN3-204	ENST00000469376	CHKA	P35790	457 aa		27.51	■■□□□ 1.99
OPN3-204	ENST00000469376	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
OPN3-204	ENST00000469376	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		27.51	■■□□□ 1.99
OPN3-204	ENST00000469376	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		27.51	■■□□□ 1.99
OPN3-204	ENST00000469376	FNBP1	Q96RU3	617 aa		27.51	■■□□□ 1.99
OPN3-204	ENST00000469376	TRIM7	Q9C029	511 aa		27.51	■■□□□ 1.99
OPN3-204	ENST00000469376	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		27.51	■■□□□ 1.99
OPN3-204	ENST00000469376	HLA-DRA	P01903	254 aa		27.5	■■□□□ 1.99

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