RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 KLHL5Q96PQ7 755 aa19.81■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 GPR62Q9BZJ7 368 aa19.81■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 CHST7Q9NS84 486 aa19.81■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 CDH22Q9UJ99 828 aa19.81■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 ADAM28Q9UKQ2 775 aa19.81■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 CASTOR2A6NHX0 329 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 C2CD2LO14523 706 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 GARTP22102 1010 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 NR2F2P24468 414 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 RPL13P26373 211 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 DSG1Q02413 1049 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 SLFN12LQ6IEE8 588 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 FUT10Q6P4F1 479 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 CBWD1Q9BRT8 395 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 THAP9Q9H5L6 903 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 DZANK1Q9NVP4 752 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 FANCLQ9NW38 375 aa19.8■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 LOC730098B7Z3J9 87 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 CETN3O15182 167 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 CLIC2O15247 247 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 ZNF18P17022 549 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 GRM5P41594 1212 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 GLUD2P49448 558 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 CLCN4P51793 760 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 ADAM9Q13443 819 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 GSE1Q14687 1217 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 CDKAL1Q5VV42 579 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 ARMCX5Q6P1M9 558 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 PPFIBP1Q86W92 1011 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 B3GALT6Q96L58 329 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 ADAM7Q9H2U9 754 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 C11orf16Q9NQ32 467 aa19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 A0A0B4J269 797 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 KIF4AO95239 1232 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 MCF2P10911 925 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 KLRC2P26717 231 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 ITIH3Q06033 890 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 MCL1Q07820 350 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 GLRA4Q5JXX5 417 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 MPZL3Q6UWV2 235 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 ZBTB33Q86T24 672 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 IRF2BP1Q8IU81 584 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 POMGNT1Q8WZA1 660 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 RXFP1Q9HBX9 757 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 HSPBP1Q9NZL4 362 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa19.78■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 TEX28O15482 410 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 CLDN3O15551 220 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 DCXO43602 365 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 TADA2AO75478 443 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 OSTNP61366 133 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 TPM4P67936 248 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 USP41Q3LFD5 358 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 XKR4Q5GH76 650 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 ALKAL1Q6UXT8 129 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 RNF135Q8IUD6 432 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 HASPINQ8TF76 798 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 EEF2KMTQ96G04 330 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 TCHPQ9BT92 498 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 HAPLN2Q9GZV7 340 aa19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.76
PTX4-201ENST00000293922 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 ALADP13716 330 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 CYP2J2P51589 502 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 UVSSAQ2YD98 709 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 KIAA1841Q6NSI8 718 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 CES5AQ6NT32 575 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 GPR65Q8IYL9 337 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 XXYLT1Q8NBI6 393 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 FEZF2Q8TBJ5 459 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 FBXL18Q96ME1 805 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 MKNK1Q9BUB5 465 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 GPR37L1O60883 481 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 AKAP3O75969 853 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 GNA14O95837 355 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 ADH1AP07327 375 aa19.76■□□□□ 0.75
PTX4-201ENST00000293922 WEE2P0C1S8 567 aa19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms