RNA–Protein interactions for RNA: YKL095W

YJU2, Transcript of Essential protein required for pre-mRNA splicing, yeast

Gene YJU2, Length 837 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJU2	YKL095W	PET54	P10834	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	SEC22	P22214	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	ZRT3	P34240	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	MIC19	P43594	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	MOG1	P47123	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	MAK3	Q03503	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	DYN3	Q04949	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	TCA17	P32613	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	PTM1	P32857	523 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YHL044W	P38727	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	FMP32	P43557	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	COQ5	P49017	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	FLC3	P53121	802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	COG5	P53951	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	SIR2	P06700	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	SNF4	P12904	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	SMP1	P38128	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	DOG1	P38774	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	RMD6	P39975	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YER189W	P40104	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YGL204C	P53089	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YGL118C	P53132	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	DID2	P69771	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	PLP1	Q04004	230 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	EPT1	P22140	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	DOG2	P38773	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YIL054W	P40524	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	AGE2	P40529	298 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YJL028W	P47062	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YML122C	Q03207	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	EMI1	Q04406	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	SUE1	Q06524	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	TIM22	Q12328	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	UBC8	P28263	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	SYS1	P41544	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YMD8	Q03697	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	ECM11	Q04110	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	ATG5	Q12380	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YJU2	YKL095W	CDC7	P06243	507 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	SCO1	P23833	295 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	AHC2	P25649	128 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	UPS2	P35200	230 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	YGR050C	P53231	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	HST4	P53688	370 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	AIM34	Q03673	198 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	SLD7	Q08457	257 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	CYC2	P38909	366 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	TEM1	P38987	245 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	ECM19	Q06011	112 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	SHH4	Q06236	168 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	MHT1	Q12525	324 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	YCR023C	P25351	611 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	GPI18	P38211	433 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	TRR2	P38816	342 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	YLR462W	O13556	202 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	FCY2	P17064	533 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	YEL075C	P39972	122 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	RRT13	P40042	185 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	GLE2	P40066	365 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	HSK3	P69852	69 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	TVP15	Q03860	143 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YJU2	YKL095W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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