RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-204	ENST00000561685	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	C1R	P00736	705 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	CKB	P12277	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	OSM	P13725	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	PCSK1	P29120	753 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ERVK-21	P61565	698 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	HSD11B2	P80365	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	MTM1	Q13496	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	DDC	P20711	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	AGXT	P21549	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SLC6A2	P23975	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	VAV2	P52735	878 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	CREM	Q03060	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	PRSS23	O95084	383 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	AMY1A	P04745	511 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	WAS	P42768	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	RARRES1	P49788	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	LNX2	Q8N448	690 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	MYOC	Q99972	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRN3-204	ENST00000561685	HAUS5	O94927	633 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	PLA2G5	P39877	138 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	CTXN1	P60606	82 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	LMO1	P25800	156 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	IL12RB1	P42701	662 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	NOMO3	P69849	1222 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	NHLH1	Q02575	133 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRN3-204	ENST00000561685	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms