RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 ITIH3Q06033 890 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 UNC13DQ70J99 1090 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 HPS3Q969F9 1004 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 FBXL18Q96ME1 805 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 TMEM206Q9H813 350 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 CITO14578 2027 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 TRAPPC3O43617 180 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 GARTP22102 1010 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 CASP1P29466 404 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 HOXD13P35453 343 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 AFMP43652 599 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 ACOT2P49753 483 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 CUL4BQ13620 913 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 LILRA6Q6PI73 481 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 KIF12Q96FN5 646 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 PAGE5Q96GU1 130 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 ASB7Q9H672 318 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 DERAQ9Y315 318 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-209ENST00000485765 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 PAPLNO95428 1278 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 BRCC3P46736 316 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 SPAG1Q07617 926 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 SPATA1Q5VX52 437 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 PDXDC1Q6P996 788 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 CEP57Q86XR8 500 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 GJD3Q8N144 294 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 KLRC4O43908 158 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 NDUFA8P51970 172 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 JADE1Q6IE81 842 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 APOL5Q9BWW9 433 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 TCHHQ07283 1943 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 GLUD1P00367 558 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 MYL1P05976 194 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 SYKP43405 635 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 PSMD5Q16401 504 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 KANK3Q6NY19 840 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 SUSD3Q96L08 255 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 DPP7Q9UHL4 492 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 I3L4J1 428 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 SYN3O14994 580 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 TGM5O43548 720 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 CES5AQ6NT32 575 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 PALB2Q86YC2 1186 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 FAM212AQ96EL1 285 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 MTRRQ9UBK8 725 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 C2CD2Q9Y426 696 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 ADAM12O43184 909 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 TGFB1I1O43294 461 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 EXTL3O43909 919 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D4O60343 1298 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 IL18RAPO95256 599 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 MTHFRP42898 656 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 RAB33AQ14088 237 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-209ENST00000485765 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms