RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 FAM84AQ96KN4 292 aa8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 SNED1Q8TER0 1413 aa8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 OR6B1O95007 311 aa8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 BAG3O95817 575 aa8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 PTPN4P29074 926 aa8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 INPP5DQ92835 1189 aa8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 STK33Q9BYT3 514 aa8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 RAD17O75943 681 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 SGPL1O95470 568 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 KRT15P19012 456 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 GJC1P36383 396 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 PPP2R5EQ16537 467 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 EPC2Q52LR7 807 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 MAML1Q92585 1016 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 AGPAT1Q99943 283 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 GALNT8Q9NY28 637 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 E7ENQ6 273 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 CDH16O75309 829 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 PSMG1O95456 288 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 EYA4O95677 639 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 LYNP07948 512 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 FAM163BP0C2L3 166 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ADRA1DP25100 572 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 MYBPC3Q14896 1274 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 PTPRN2Q92932 1015 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 CD101Q93033 1021 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 NUP85Q9BW27 656 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 SKIP12755 728 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 RASSF2P50749 326 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 DEUP1Q05D60 604 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.062e-18■■■■□ 20.8
TPM3-215ENST00000469717 PRR16Q569H4 304 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 POTEAQ6S8J7 498 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 KCTD1Q719H9 257 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 CROCCP2Q86T23 111 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 TRABDQ9H4I3 376 aa8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ABLIM1O14639 778 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 GSC2O15499 205 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 SERPINB3P29508 390 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 USP46P62068 366 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 CYP1B1Q16678 543 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 TRABD2AQ86V40 505 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 TTC1Q99614 292 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 EURLQ9NYK6 297 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 HEY2Q9UBP5 337 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 USP17L10C9JJH3 530 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 PDXKO00764 312 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 GYG2O15488 501 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 CALUO43852 315 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 CAMTA2O94983 1202 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ETS1P14921 441 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 SLC34A1Q06495 639 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 LRRC6Q86X45 466 aa8.43□□□□□ -1.06
TPM3-215ENST00000469717 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms