RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 FUT8Q9BYC5 575 aa18.48■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 CNTN6Q9UQ52 1028 aa18.48■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa18.48■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 B4GALT4O60513 344 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 MTA2O94776 668 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 CYP1A2P05177 515 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 IRF5Q13568 498 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM192Q8IY95 271 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 UBR7Q8N806 425 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 ACTRT1Q8TDG2 376 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 USP6NLQ92738 828 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 SELENOOQ9BVL4 669 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 IMPG2Q9BZV3 1241 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 A6NJR5 290 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 CEP104O60308 925 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 ZEB2O60315 1214 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 MYL6P60660 151 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 C11orf63Q6NUN7 778 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM270Q6UE05 265 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 IFNL1Q8IU54 200 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 GTF3C4Q9UKN8 822 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 ZMYND10O75800 440 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 CLSTN1O94985 981 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 MCF2P10911 925 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 UNGP13051 313 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 CBX1P83916 185 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 RASGEF1CQ8N431 466 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 HDAC7Q8WUI4 952 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 NLRP7Q8WX94 980 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF653Q96CK0 615 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 CPB2Q96IY4 423 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM59LQ9UK28 342 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 L1RE1Q9UN81 338 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGGTA-201ENST00000216840 IL18RAPO95256 599 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC10A3P09131 477 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 CXCL8P10145 99 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 CCL14Q16627 93 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 OLFML2BQ68BL8 750 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 SETD4Q9NVD3 440 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 ALG6Q9Y672 507 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 STAG3L1P0CL83 205 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 TRPC3Q13507 836 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 KRT222Q8N1A0 295 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 RUBCNQ92622 972 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 NUP85Q9BW27 656 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 TNNC2P02585 160 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 CYP2C19P33261 490 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 PLA2G4AP47712 749 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF132P52740 706 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 C8orf74Q6P047 294 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 KAT2BQ92831 832 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.544e-7■■□□□ 11.9
RABGGTA-201ENST00000216840 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP2K7O14733 419 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 TSPAN1O60635 241 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 F2P00734 622 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 CYP2B6P20813 491 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 GNA15P30679 374 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC7A5Q01650 507 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 DCAF12L1Q5VU92 463 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 TLK2Q86UE8 772 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF410Q86VK4 478 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 MCOLN2Q8IZK6 566 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 SCLT1Q96NL6 688 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 NIF3L1Q9GZT8 377 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 XYLT2Q9H1B5 865 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 UVRAGQ9P2Y5 699 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 GJD2Q9UKL4 321 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 LACTBL1A8MY62 500 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 CFHP08603 1231 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-201ENST00000216840 RGS2P41220 211 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms