RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622815.1

DUXAP9-208, Transcript of double homeobox A pseudogene 9, human

BASIC

Gene DUXAP9, Length 614 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DUXAP9-208	ENST00000622815	POMC	P01189	267 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ATP5J	P18859	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	PIF1	Q9H611	641 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ECHS1	P30084	290 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	NHLH1	Q02575	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	APPBP2	Q92624	585 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	MYOC	Q99972	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	FPR1	P21462	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	GCSH	P23434	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SREBF1	P36956	1147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ID4	P47928	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SP140	Q13342	867 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	DDB2	Q92466	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	FEZ1	Q99689	392 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ZFPL1	O95159	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ENPP1	P22413	925 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ZNF81	P51508	661 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	VAV2	P52735	878 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	PEX1	O43933	1283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	CKB	P12277	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	IL2RB	P14784	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	PROK1	P58294	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ADRM1	Q16186	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	USP7	Q93009	1102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	NEMP1	O14524	444 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	CDC45	O75419	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	NOMO3	P69849	1222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DUXAP9-208	ENST00000622815	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms