RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PHEXP78562 749 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PRKCZQ05513 592 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF235Q14590 738 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SFR1Q86XK3 245 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ACKR2O00590 384 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CKMP06732 381 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 GUCY2CP25092 1073 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CDC27P30260 824 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 GLUD2P49448 558 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 UBE3AQ05086 875 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC63Q8NA47 563 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SPATA18Q8TC71 538 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 KRT35Q92764 455 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 VPS16Q9H269 839 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TMX1Q9H3N1 280 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 DPP3Q9NY33 737 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGAP6O43182 974 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 LRMPQ12912 555 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PKN1Q16512 942 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ISM2Q6H9L7 571 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RTL10Q7L3V2 364 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RRAGAQ7L523 313 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RFX6Q8HWS3 928 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ADAM2Q99965 735 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SETD4Q9NVD3 440 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 GCNT4Q9P109 453 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 RNF14Q9UBS8 474 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PIK3C2AO00443 1686 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 AKAP12Q02952 1782 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 H7C0C1 242 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 HSF2BPO75031 334 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 TMCC1O94876 653 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 GHRP10912 638 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.343e-7■■□□□ 12.8
SMAD4-212ENST00000591126 CHKAP35790 457 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ATP5OP48047 213 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SKP1P63208 163 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 WASHC5Q12768 1159 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 KCNA10Q16322 511 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 FBXO32Q969P5 355 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 M0QYV0 167 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 OPA1O60313 960 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ADH1CP00326 375 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 CPA1P15085 419 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 KLRK1P26718 216 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 MAPK8P45983 427 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 ACLYP53396 1101 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 COASYQ13057 564 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 FBXL16Q8N461 479 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 KCTD6Q8NC69 237 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-212ENST00000591126 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.68□□□□□ -1.34
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