RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ZP2	Q05996	745 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMD5	Q16401	504 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	SFR1	Q86XK3	245 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	APPL2	Q8NEU8	664 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	BEST2	Q8NFU1	509 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF12	Q96FN5	646 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA32	Q96LK8	384 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	APOL5	Q9BWW9	433 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	CNTN3	Q9P232	1028 aa		12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	PODXL	O00592	558 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX28	O15482	410 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	DCX	O43602	365 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF4A	O95239	1232 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	PIGR	P01833	764 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	ELF1	P32519	619 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	MCM4	P33991	863 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	CLCN4	P51793	760 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	CLCNKB	P51801	687 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	UPP1	Q16831	310 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	USP49	Q70CQ1	688 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	USP37	Q86T82	979 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	CHST7	Q9NS84	486 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	USP25	Q9UHP3	1055 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0C4DFX4	3053 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		12.34	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	CIT	O14578	2027 aa		12.33	□□□□□ -0.43
TTLL3-231	ENST00000496246	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	MYMK	A6NI61	221 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	SYN3	O14994	580 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	B4GALT3	O60512	393 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	EDN1	P05305	212 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	CXCL8	P10145	99 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	EPCAM	P16422	314 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP3A5	P20815	502 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	NUCB2	P80303	420 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNC3	Q14003	757 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	XKR4	Q5GH76	650 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	PALB2	Q86YC2	1186 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP120	Q8N960	986 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	RABGGTA	Q92696	567 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	ASB7	Q9H672	318 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		12.33	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	XYLB	O75191	536 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	IL18RAP	O95256	599 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	RTL10	Q7L3V2	364 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	SUSD6	Q92537	303 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246	DERA	Q9Y315	318 aa		12.32	□□□□□ -0.44
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0B4J269	797 aa		12.31	□□□□□ -0.44

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