RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 PARD3BQ8TEW8 1205 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 SLC9A7Q96T83 725 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC10BA6NIK2 292 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 KCNJ18B7U540 433 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 PTGESO14684 152 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 DGKIO75912 1065 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 SCNN1GP51170 649 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 DLG4P78352 724 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 KCNJ12Q14500 433 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 SURF1Q15526 300 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 JADE1Q6IE81 842 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 TMC2Q8TDI7 906 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 FNBP1Q96RU3 617 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 MIOSQ9NXC5 875 aa32.04■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa32.03■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 TPM3P06753 285 aa32.03■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa32.03■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
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ECHS1-201ENST00000368547 INPPL1O15357 1258 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 NFICP08651 508 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 KCNE1P15382 129 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 HS1BP3Q53T59 392 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 TCP11X2Q5H9J9 407 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 NOMO2Q5JPE7 1267 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 EFCAB13Q8IY85 973 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 KIF12Q96FN5 646 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 CASD1Q96PB1 797 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM117Q9H0C3 514 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 COL4A6Q14031 1691 aa32.02■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 POMCP01189 267 aa32.01■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM49P0CI25 452 aa32.01■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM49CP0CI26 452 aa32.01■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 PTPRJQ12913 1337 aa32.01■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 USP37Q86T82 979 aa32.01■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM59Q8IWR1 403 aa32.01■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 URGCPQ8TCY9 931 aa32.01■■■□□ 2.72
ECHS1-201ENST00000368547 TBKBP1A7MCY6 615 aa32■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa32■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 GJB5O95377 273 aa32■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 TNNI1P19237 187 aa32■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 BMP8BP34820 402 aa32■■■□□ 2.71
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ECHS1-201ENST00000368547 TCERG1LQ5VWI1 586 aa32■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 HERC6Q8IVU3 1022 aa32■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 CGRRF1Q99675 332 aa32■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 THP07101 528 aa32■■■□□ 2.71
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ECHS1-201ENST00000368547 WDR49Q8IV35 697 aa32■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 FAM84AQ96KN4 292 aa32■■■□□ 2.71
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ECHS1-201ENST00000368547 ZBED2Q9BTP6 218 aa32■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 DERAQ9Y315 318 aa32■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 C2CD2Q9Y426 696 aa32■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GTH6 734 aa31.99■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 CLDN10P78369 228 aa31.99■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35C1Q96A29 364 aa31.99■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
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ECHS1-201ENST00000368547 GRIK3Q13003 919 aa31.98■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB6Q15916 424 aa31.98■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 TSPAN18Q96SJ8 248 aa31.98■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 YME1L1Q96TA2 773 aa31.98■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D13Q9NVG8 400 aa31.98■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 INTS13Q9NVM9 706 aa31.98■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP31.98■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 NT5DC4Q86YG4 428 aa31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 OR5B17Q8NGF7 314 aa31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 RSPH1Q8WYR4 309 aa31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF516Q92618 1163 aa31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 KRT31Q15323 416 aa31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 NAB2Q15742 525 aa31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 FILIP1LQ4L180 1135 aa31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 MTMR12Q9C0I1 747 aa31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 MMRN2Q9H8L6 949 aa31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM191BP0C7N4 346 aa31.96■■■□□ 2.71
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