RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 GINM1Q9NU53 330 aa18.13■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 CYP11B2P19099 503 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 FMO5P49326 533 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ALCAMQ13740 583 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 TMC3Q7Z5M5 1100 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 MORC4Q8TE76 937 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 APEX2Q9UBZ4 518 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 EMSYQ7Z589 1322 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 SREBF1P36956 1147 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 TTLL4Q14679 1199 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 STAT4Q14765 748 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 MTRQ99707 1265 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 SIK3Q9Y2K2 1263 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ATRNO75882 1429 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 GOLGA8SH3BPF8 625 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 GOLGA8MH3BSY2 632 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 STAM2O75886 525 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 COMTP21964 271 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 SCYL2Q6P3W7 929 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ABCC6O95255 1503 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ERFP50548 548 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 VAMP7P51809 220 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 DTX3LQ8TDB6 740 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 OSGEPQ9NPF4 335 aa18.12■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 YDJCA8MPS7 323 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 GHRP10912 638 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 PSMC6P62333 389 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 KAT2BQ92831 832 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 RNF34Q969K3 372 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 Q9H521 79 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 H7C0C1 242 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ATP5OP48047 213 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 RFX8Q6ZV50 586 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM42Q8IWZ5 723 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 C18orf8Q96DM3 657 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 TTC1Q99614 292 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 SEMA4AQ9H3S1 761 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 TRABDQ9H4I3 376 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 KLRC4O43908 158 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 NOL3O60936 208 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 RNF8O76064 485 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 PON1P27169 355 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ARFIP2P53365 341 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 FUT2Q10981 343 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 CD302Q8IX05 232 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 RIT2Q99578 217 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 KIFC3Q9BVG8 833 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 RUSC1Q9BVN2 902 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.11■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ADM5C9JUS6 153 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 FAM86B1E9PN63 330 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 FAM86B2P0C5J1 330 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 DGKZQ13574 1117 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 C7orf31Q8N865 590 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 HIPK4Q8NE63 616 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 FAM161BQ96MY7 647 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ADAM22Q9P0K1 906 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ZWINTO95229 277 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ITIH2P19823 946 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 TNFRSF8P28908 595 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 PPP2R5DQ14738 602 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 MIIPQ5JXC2 388 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 FAM81BQ96LP2 452 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 TTC25Q96NG3 672 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 FAM47DPA6NHR8 397 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 TKFCQ3LXA3 575 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 C4orf33Q8N1A6 199 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 MREGQ8N565 214 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 RNF149Q8NC42 400 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 GSDMBQ8TAX9 411 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 DNAJC9Q8WXX5 260 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 THAP2Q9H0W7 228 aa18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 CYP26A1O43174 497 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 PGK2P07205 417 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 DNAJC24Q6P3W2 148 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 ATL2Q8NHH9 583 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 C11orf70Q9BRQ4 267 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 BCAP29Q9UHQ4 241 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 RTN2O75298 545 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 DNAJC3Q13217 504 aa18.09■□□□□ 0.49
TRPC1-201ENST00000273482 TRADDQ15628 312 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms