RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259216.4

CFC1-201, Transcript of cripto, FRL-1, cryptic family 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFC1, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1-201ENST00000259216 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.14■■□□□ 1.14
CFC1-201ENST00000259216 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CFC1-201ENST00000259216 RFPL2O75678 378 aa22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 B3GAT3O94766 335 aa22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 FAM13AO94988 1023 aa22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 SCP2P22307 547 aa22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ZXDAP98168 799 aa22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 PALB2Q86YC2 1186 aa22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 MYCT1Q8N699 235 aa22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 USTQ9Y2C2 406 aa22.14■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TTC26A0AVF1 554 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 CLDN3O15551 220 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TRAK2O60296 914 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 PPP1R37O75864 691 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 SPATA31D3P0C874 917 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 GTF2BQ00403 316 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 CREMQ03060 361 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 PTPN21Q16825 1174 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 STRA6Q9BX79 667 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 NR2E1Q9Y466 385 aa22.13■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 A0A0B4J269 797 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 MYMKA6NI61 221 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 K7ENM7 598 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ADRB2P07550 413 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 MYBP10242 640 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 BRCC3P46736 316 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ZBTB6Q15916 424 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 PSMD5Q16401 504 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 MTRRQ9UBK8 725 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.12■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 I3L4J1 428 aa22.11■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 CLTAP09496 248 aa22.11■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 CXCL8P10145 99 aa22.11■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TNFSF9P41273 254 aa22.11■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.11■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.11■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 CEP57Q86XR8 500 aa22.11■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.11■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 MYO10Q9HD67 2058 aa22.11■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 PODXLO00592 558 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 RAB33AQ14088 237 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 SFR1Q86XK3 245 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 DDX12PQ92771 950 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ASIC4Q96FT7 647 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.1■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TISP43B9A030 160 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 OGTO15294 1046 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TBC1D4O60343 1298 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ZMYND10O75800 440 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 LIG4P49917 911 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 PKP1Q13835 747 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 DYMQ7RTS9 669 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 HSCBQ8IWL3 235 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 BICD1Q96G01 975 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.09■■□□□ 1.13
CFC1-201ENST00000259216 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.2 ms