RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 RFFLQ8WZ73 363 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-212ENST00000488380 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
NISCH-212ENST00000488380 FAM20AQ96MK3 541 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-212ENST00000488380 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.4□□□□□ -0.1
NISCH-212ENST00000488380 PFASO15067 1338 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 PODXLO00592 558 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 GM2AP17900 193 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 EPHB2P29323 1055 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 CIITAP33076 1130 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 MPP2Q14168 576 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 EPAS1Q99814 870 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.39□□□□□ -0.118e-8■■■■□ 21.8
NISCH-212ENST00000488380 SCOCQ9UIL1 159 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 VSTM1Q6UX27 236 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 MYCT1Q8N699 235 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.39□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 H0YIN7 160 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 PDXKO00764 312 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 EYA4O95677 639 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 CCNB1P14635 433 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ATP5DP30049 168 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 CHRNA3P32297 505 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 STAT2P52630 851 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 RCN2Q14257 317 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 PRELID2Q8N945 189 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 FGD4Q96M96 766 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 MRIQ9BWK5 157 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 PHF2O75151 1096 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 NPTXRO95502 500 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 CUL3Q13618 768 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 KYNUQ16719 465 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 TTC27Q6P3X3 843 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 THAP2Q9H0W7 228 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ALG6Q9Y672 507 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 CBX6O95503 412 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ARP10275 920 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 TNFAIP3P21580 790 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 MARCKSL1P49006 195 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 NPEPPSP55786 919 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 DNAJC3Q13217 504 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 KRT35Q92764 455 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ITFG2Q969R8 447 aa14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 WFS1O76024 890 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 PRKCIP41743 596 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 PSMD10O75832 226 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 RNF8O76064 485 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 VPS41P49754 854 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 MESDQ14696 234 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.37□□□□□ -0.11
NISCH-212ENST00000488380 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms