RNA–Protein interactions for RNA: YBL039C

URA7, Transcript of Major CTP synthase isozyme (see also URA8), yeast

Gene URA7, Length 1,740 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA7	YBL039C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.65	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	SNA3	P14359	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	CBS2	P14905	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MDM10	P18409	493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	SHG1	P38337	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	PET8	P38921	284 aa		4.64	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	GOR1	P53839	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YNL140C	P53910	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	URA6	P15700	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	AEP1	P32493	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	FIG1	P38224	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	WSC4	P38739	605 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	PEX22	P39718	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	KRE29	P40026	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	SER33	P40510	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	TRM9	P49957	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	FYV6	P53913	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YLR152C	P54072	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YML018C	Q03730	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YET2	Q04210	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	PEX12	Q04370	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MEI4	P29467	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	TRS65	P32893	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	RCK1	P38622	512 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	VAB2	P40003	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	FAR10	Q06001	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	GAS2	Q06135	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MCT1	Q12283	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	SIR4	P11978	1358 aa		4.63	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	CAF4	P36130	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	GOS1	P38736	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YKE4	P40544	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	HAC1	P41546	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	GAB1	P41733	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	SCS3	P53012	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	BRR6	P53062	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MMS2	P53152	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	VPS60	Q03390	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	COQ10	Q08058	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MMT2	Q08970	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	RFM1	Q12192	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	HMS1	Q12398	434 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MHP1	P43638	1398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	PMT2	P31382	759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	DRE2	P36152	348 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MRP21	P38175	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YJL016W	P47072	561 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	SCS7	Q03529	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	SPC2	Q04969	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	GGA1	Q06336	557 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YNG1	Q08465	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	AYT1	Q12226	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	CYC3	P06182	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	PUT1	P09368	476 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	PPH21	P23594	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	URA10	P30402	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	SGE1	P33335	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MED8	P38304	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	CHL4	P38907	458 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	HEM14	P40012	539 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MCM22	P47167	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	OST3	P48439	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MIG2	P53035	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YLR460C	P54007	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	SNO1	Q03144	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MRS3	P10566	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	POP7	P38291	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
URA7	YBL039C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	MDV1	P47025	714 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	NRM1	P53718	249 aa		4.6	□□□□□ -1.67
URA7	YBL039C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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