RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 K7ESF4 209 aa12.91□□□□□ -0.34
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CAPNS1-209ENST00000590049 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CAPNS1-209ENST00000590049 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
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CAPNS1-209ENST00000590049 USP28Q96RU2 1077 aa12.87□□□□□ -0.35
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