RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 A0A0B4J269 797 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-210ENST00000574217 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-210ENST00000574217 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-210ENST00000574217 ABLIM1O14639 778 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-210ENST00000574217 OGTO15294 1046 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-210ENST00000574217 EXTL3O43909 919 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-210ENST00000574217 EXOC3O60645 756 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-210ENST00000574217 UPP2O95045 317 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-210ENST00000574217 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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PRPF8-210ENST00000574217 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF8-210ENST00000574217 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.3□□□□□ -1.24
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PRPF8-210ENST00000574217 C9IYK1 514 aa7.29□□□□□ -1.24
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PRPF8-210ENST00000574217 STAG3L1P0CL83 205 aa7.28□□□□□ -1.24
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PRPF8-210ENST00000574217 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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PRPF8-210ENST00000574217 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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