RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 HHEXQ03014 270 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 HGFACQ04756 655 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 PPP3CAQ08209 521 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ABHD18Q0P651 414 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 FHL2Q14192 279 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 NXNQ6DKJ4 435 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 GPR156Q8NFN8 814 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 COA7Q96BR5 231 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 UIMC1Q96RL1 719 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SLC26A4O43511 780 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ACRV1P26436 265 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ADCY7P51828 1080 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SLC16A1P53985 500 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 UBE3CQ15386 1083 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 TPH2Q8IWU9 490 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 MIER2Q8N344 545 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 D2HGDHQ8N465 521 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 IL17DQ8TAD2 202 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SNX33Q8WV41 574 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 NRG4Q8WWG1 115 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ADI1Q9BV57 179 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 NELFAQ9H3P2 528 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 RPTORQ8N122 1335 aa6.44□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 MTSS1O43312 755 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ALDH1A2O94788 518 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 AKAP5P24588 427 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 CYP2C19P33261 490 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 KIR2DL3P43628 341 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 MGAT2Q10469 447 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 TCIRG1Q13488 830 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 MSL2Q9HCI7 577 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 DNM3Q9UQ16 869 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 IPPQ9Y573 584 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 HMGXB3Q12766 1538 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.43□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 OVOL3O00110 214 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 PRAMEF4O60810 478 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 TOX4O94842 621 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 POU2F2P09086 479 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 EDNRBP24530 442 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 WNT3AP56704 352 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 TGFB2P61812 414 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ADAM8P78325 824 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 GAGE13Q4V321 117 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 AIFM3Q96NN9 605 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ING3Q9NXR8 418 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 KIF27Q86VH2 1401 aa6.42□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 CAPN14A8MX76 684 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 AKR1B10O60218 316 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 PHF2O75151 1096 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 MCM7P33993 719 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 BPIFB4P59827 614 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 RIN1Q13671 783 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 GTF2H3Q13889 308 aa6.41□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ACAP1Q15027 740 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms