RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493711.1

SNX17-208, Transcript of sorting nexin 17, human

TSL 3

Gene SNX17, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX17-208	ENST00000493711	EXOC3	O60645	756 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF623	O75123	536 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	EOMES	O95936	686 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	CSF2RA	P15509	400 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ADSS	P30520	456 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	GRM5	P41594	1212 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ENPEP	Q07075	957 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	GPNMB	Q14956	572 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	CDT1	Q9H211	546 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	CEP290	O15078	2479 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	CLIC2	O15247	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	NPTXR	O95502	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	EDN1	P05305	212 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	CYP2J2	P51589	502 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	STX17	P56962	302 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	FAM189B	P81408	668 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	SURF1	Q15526	300 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	CD302	Q8IX05	232 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	BAD	Q92934	168 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ENPP3	O14638	875 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	HOXA2	O43364	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	IL18RAP	O95256	599 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	FGB	P02675	491 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	KRT13	P13646	458 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ITGB8	P26012	769 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	SPAG1	Q07617	926 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	ACAP3	Q96P50	834 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SNX17-208	ENST00000493711	C2orf72	A6NCS6	295 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	TISP43	B9A030	160 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711		C9IYK1	514 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	STX10	O60499	249 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	AMH	P03971	560 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	TPM2	P07951	284 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	ITGA4	P13612	1032 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	ASB7	Q9H672	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SNX17-208	ENST00000493711	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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