RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDXDC1Q6P996 788 aa18.46■□□□□ 0.55
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q4G0T1 1027 aa18.44■□□□□ 0.54
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF149Q8NC42 400 aa18.44■□□□□ 0.54
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.44■□□□□ 0.54
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 CXCL12P48061 93 aa18.43■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GJA10Q969M2 543 aa18.43■□□□□ 0.54
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP170P1Q96L14 293 aa18.43■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOL6Q9BWW8 343 aa18.43■□□□□ 0.54
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 ING5Q8WYH8 240 aa18.42■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM3CQ92520 227 aa18.42■□□□□ 0.54
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRD9Q9H8M2 597 aa18.42■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMAN1LQ9HAT1 526 aa18.42■□□□□ 0.54
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB33AQ14088 237 aa18.41■□□□□ 0.54
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FERMT3Q86UX7 667 aa18.41■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IRF7Q92985 503 aa18.41■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HRO43593 1189 aa18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTENP60484 403 aa18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TUSC3Q13454 348 aa18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LONP2Q86WA8 852 aa18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RABGGTAQ92696 567 aa18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPB2Q96IY4 423 aa18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DOCK6Q96HP0 2047 aa18.4■□□□□ 0.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TM4SF5O14894 197 aa18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHOP08100 348 aa18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP3A7P24462 503 aa18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKAP5P24588 427 aa18.39■□□□□ 0.53
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