RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.64■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NT5C1BQ96P26 610 aa23.64■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPRHQ9HD43 1115 aa23.64■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TACC1O75410 805 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHKA2P46019 1235 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MFAP3P55082 362 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPFIA1Q13136 1202 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRM1Q13255 1194 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRSK2Q8IWQ3 736 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HELQQ8TDG4 1101 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM81BQ96LP2 452 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.371e-12■■■■■ 37.1
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OGTO15294 1046 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CA12O43570 354 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WNT7BP56706 349 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRIK4Q16099 956 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD7Q92527 254 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHC3Q92529 594 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KREMEN1Q96MU8 473 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CGRRF1Q99675 332 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INTUQ9ULD6 942 aa23.63■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 F2P00734 622 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNNI1P19237 187 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCL14Q16627 93 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPZL3Q6UWV2 235 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MNS1Q8NEH6 495 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP7D2Q96T17 732 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CARD6Q9BX69 1037 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 Q9Y3F1 56 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa23.62■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP2B6P20813 491 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP2C19P33261 490 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCNT1Q02742 428 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TLK2Q86UE8 772 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOX5Q96PH1 765 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALS2CR12Q96Q35 445 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCHPQ9BT92 498 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNFSF13BQ9Y275 285 aa23.61■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPRJQ12913 1337 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF3CO14782 793 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AP3M2P53677 418 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JRKLQ9Y4A0 524 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANK1P16157 1881 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TADA3O75528 432 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MOCS3O95396 460 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KAT5Q92993 513 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PACSIN1Q9BY11 444 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKT3Q9Y243 479 aa23.6■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IQCF3P0C7M6 154 aa23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SURF1Q15526 300 aa23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB33Q86T24 672 aa23.59■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A087WZ62 844 aa23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HARSP12081 509 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMHR2Q16671 573 aa23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR49Q8IV35 697 aa23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP112Q8N8E3 955 aa23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.58■■□□□ 1.37
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRCAMQ92823 1304 aa23.58■■□□□ 1.36
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENC1O14682 589 aa23.57■■□□□ 1.36
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B4GALT5O43286 388 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms