RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547201.5

USP25-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 757 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-209ENST00000547201 CALM3P0DP25 149 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 GJB2P29033 226 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 RGS2P41220 211 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 RCAN1P53805 252 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 BEX3Q00994 111 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 KCTD2Q14681 263 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 LRRC14Q15048 493 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 KRT40Q6A162 431 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 C12orf40Q86WS4 652 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 CHST13Q8NET6 341 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 MORC4Q8TE76 937 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 FBF1Q8TES7 1133 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 FAM84AQ96KN4 292 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 TINF2Q9BSI4 451 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 ANO3Q9BYT9 981 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 MROH8Q9H579 483 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
USP25-209ENST00000547201 LTBP2Q14767 1821 aa6.34□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 BTBD18B2RXH4 712 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ATP9AO75110 1047 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 FBXO24O75426 580 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 EOMESO95936 686 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ARP10275 920 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 NT5C2P49902 561 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ADCY7P51828 1080 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 CCNA1P78396 465 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 MESP2Q0VG99 397 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 LY6KQ17RY6 165 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 DPP9Q86TI2 863 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 TMTC2Q8N394 836 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 DEFB118Q96PH6 123 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 RMDN3Q96TC7 470 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 FOXQ1Q9C009 403 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ARID2Q68CP9 1835 aa6.33□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 TMEM150BA6NC51 233 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 DEXIO95424 95 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 CCNE2O96020 404 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 MMP1P03956 469 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 POLR2MP0CAP2 368 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ZNF286BP0CG31 522 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 SMARCA1P28370 1054 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 PSMC6P62333 389 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 SP4Q02446 784 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 GRIN1Q05586 938 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ARHGAP1Q07960 439 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 KIF22Q14807 665 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 INF2Q27J81 1249 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 TKFCQ3LXA3 575 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 FERMT3Q86UX7 667 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 LRRC15Q8TF66 581 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.31□□□□□ -1.4
USP25-209ENST00000547201 GRIN2DO15399 1336 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms