RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 NDUFS2O75306 463 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 RFPL1O75677 317 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CD69Q07108 199 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 NFYCQ13952 458 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 PPP2R5AQ15172 486 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 LRRC41Q15345 812 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 Q6ZSN1 163 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 FATE1Q969F0 183 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 FAM89AQ96GI7 184 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 SCOCQ9UIL1 159 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.5□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PR48 441 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 TSPAN6O43657 245 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MARCH6O60337 910 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 FSBPO95073 299 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 LY86O95711 162 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 SCGB1D2O95969 90 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MGAT5Q09328 741 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MALLQ13021 153 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CLEC14AQ86T13 490 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CFHR4Q92496 578 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 OR10A2Q9H208 303 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.49□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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TRDN-204ENST00000542443 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 DUSP8Q13202 625 aa6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ADAM15Q13444 863 aa6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MIIPQ5JXC2 388 aa6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CHPFQ8IZ52 775 aa6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 GREM2Q9H772 168 aa6.48□□□□□ -1.37
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TRDN-204ENST00000542443 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 C2orf78A6NCI8 922 aa6.47□□□□□ -1.37
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TRDN-204ENST00000542443 DGCR2P98153 550 aa6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 FOXL1Q12952 345 aa6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 LPPQ93052 612 aa6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 ZNF503Q96F45 646 aa6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 WDR97A6NE52 1622 aa6.47□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.46□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.46□□□□□ -1.37
TRDN-204ENST00000542443 DAPK3O43293 454 aa6.46□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 ZNF202O95125 648 aa6.46□□□□□ -1.38
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TRDN-204ENST00000542443 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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TRDN-204ENST00000542443 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.46□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 GPR135Q8IZ08 494 aa6.46□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 PPM1NQ8N819 430 aa6.46□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.46□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.46□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 TLR9Q9NR96 1032 aa6.46□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 IL33O95760 270 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 C1SP09871 688 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 CTSSP25774 331 aa6.45□□□□□ -1.38
TRDN-204ENST00000542443 WASP42768 502 aa6.45□□□□□ -1.38
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