RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 USP29Q9HBJ7 922 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RASA4BC9J798 803 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RASA4O43374 803 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CIB2O75838 187 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 GAS8O95995 478 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PRKCIP41743 596 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 KCNJ1P48048 391 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MTMR2Q13614 643 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 LPIN1Q14693 890 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PKN1Q16512 942 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 KYNUQ16719 465 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 LPCAT4Q643R3 524 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC62Q6P9F0 684 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CLEC4GQ6UXB4 293 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 DYMQ7RTS9 669 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PRUNE1Q86TP1 453 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RNF169Q8NCN4 708 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 GSDMBQ8TAX9 411 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 HEPHQ9BQS7 1158 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 KLRC4O43908 158 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ZBED4O75132 1171 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TRPA1O75762 1119 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 NEK2P51955 445 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 EMP3P54852 163 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 NOP14P78316 857 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RELAQ04206 551 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CALCOCO2Q13137 446 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ACVR2BQ13705 512 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 C1orf146Q5VVC0 180 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 BTNL9Q6UXG8 535 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 FAM186BQ8IYM0 893 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CEP295NLQ96MC4 621 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SEMA6BQ9H3T3 888 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TRPC7Q9HCX4 862 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TMOD2Q9NZR1 351 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SFI1A8K8P3 1242 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 VILLO15195 856 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TOM1O60784 492 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RHOBTB3O94955 611 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SCG2P13521 617 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 GRAMD1BQ3KR37 738 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 NADK2Q4G0N4 442 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PAOXQ6QHF9 649 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RGS9BPQ6ZS82 235 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 NELFCDQ8IXH7 590 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF654Q8IZM8 581 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RASGRP4Q8TDF6 673 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SHISA4Q96DD7 197 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 IGSF1Q8N6C5 1336 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 POTEFA5A3E0 1075 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 THAP12O43422 761 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SERPINB7O75635 380 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 EYA4O95677 639 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 IDO1P14902 403 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 STT3AP46977 705 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 AP2B1P63010 937 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PTK2Q05397 1052 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 DLG1Q12959 904 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 FYB2Q5VWT5 728 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 IYDQ6PHW0 289 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 DTHD1Q6ZMT9 781 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CLNKQ7Z7G1 428 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MYOCDQ8IZQ8 938 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 C4orf33Q8N1A6 199 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC43Q8N309 656 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RIN3Q8TB24 985 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MRGBPQ9NV56 204 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 HEY2Q9UBP5 337 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 APPL1Q9UKG1 709 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PPM1HQ9ULR3 514 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MYH4Q9Y623 1939 aa10.16□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 NRKQ7Z2Y5 1582 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms