RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 KIF22Q14807 665 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 KIAA0753Q2KHM9 967 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 TEX35Q5T0J7 233 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 PPTC7Q8NI37 304 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 NPLOC4Q8TAT6 608 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 GOLGA1Q92805 767 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 SYT11Q9BT88 431 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 MSTO1Q9BUK6 570 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 ATP8B3O60423 1300 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0B4J269 797 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 BUB1O43683 1085 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 KLRC1P26715 233 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 ACOT2P49753 483 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 GPC3P51654 580 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 CHMP4BP1P59074 171 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF484Q5JVG2 852 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 ZPBP2Q6X784 338 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 SV2AQ7L0J3 742 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 RNF149Q8NC42 400 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 FBXL13Q8NEE6 735 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 TAS1R2Q8TE23 839 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 KAT5Q92993 513 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 RNPEPQ9H4A4 650 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 SAR1BQ9Y6B6 198 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 BTNL10A8MVZ5 291 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 C22orf31O95567 290 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 LDHAP00338 332 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 PRKCBP05771 671 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 SLC30A5Q8TAD4 765 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 FAM84AQ96KN4 292 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 KREMEN1Q96MU8 473 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 NT5C1BQ96P26 610 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 TINF2Q9BSI4 451 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 RAB20Q9NX57 234 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 JRKLQ9Y4A0 524 aa13.46□□□□□ -0.25
ZNF548-201ENST00000336128 TTLL13PA6NNM8 815 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 MSCO60682 206 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF286BP0CG31 522 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 HARSP12081 509 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 SMPD1P17405 629 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 CLCN3P51790 818 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 WNT7BP56706 349 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 IGBP1P78318 339 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 CLDN10P78369 228 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 ACVR2BQ13705 512 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 TFDP1Q14186 410 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 RHPN2Q8IUC4 686 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF516Q92618 1163 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 FNBP1Q96RU3 617 aa13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 SRGAP2O75044 1071 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 GJB1P08034 283 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 H2AFZP0C0S5 128 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 INSRRP14616 1297 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 MFAP3P55082 362 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 MAPK6Q16659 721 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 H2AFVQ71UI9 128 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 DNAAF5Q86Y56 855 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 GLYCTKQ8IVS8 523 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 PPM1KQ8N3J5 372 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 METTL13Q8N6R0 699 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 OR6J1Q8NGC5 347 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 HELQQ8TDG4 1101 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 PDE11AQ9HCR9 933 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 SLC5A4Q9NY91 659 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 COL1A2P08123 1366 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 CTAGE15A4D2H0 777 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 CTAGE8P0CG41 777 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 TNFAIP3P21580 790 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 MORN1Q5T089 497 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 CTAGE6Q86UF2 777 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 CTAGE4Q8IX94 777 aa13.45□□□□□ -0.26
ZNF548-201ENST00000336128 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124 ms