RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 TCEA3O75764 348 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ZMYND10O75800 440 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ARIH2O95376 493 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 BAG3O95817 575 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC192P0DO97 292 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 KRT13P13646 458 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 HMOX2P30519 316 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ME1P48163 572 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 RAC1P63000 192 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PRKCEQ02156 737 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PPARAQ07869 468 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 GRAPQ13588 217 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 CAMK4Q16566 473 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 MOGQ16653 247 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 FAM26DQ5JW98 314 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 METTL21CQ5VZV1 264 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 TTC23LQ6PF05 361 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ADGRA1Q86SQ6 560 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 SLC22A8Q8TCC7 542 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 HAUS1Q96CS2 278 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 TTC1Q99614 292 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 MYL10Q9BUA6 226 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 EPC1Q9H2F5 836 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PSTPIP2Q9H939 334 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PLSCR2Q9NRY7 297 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 LAMA4Q16363 1823 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 SCN7AQ01118 1682 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 TAF1P21675 1872 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 GOLGA8JA6NMD2 632 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 LGR5O75473 907 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 EPN2O95208 641 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 APBB3O95704 486 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 GNA14O95837 355 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 CPA3P15088 417 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 CCND1P24385 295 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ADD1P35611 737 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 GNALP38405 381 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 TMED10P49755 219 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PPP2R2AP63151 447 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 GNGT1P63211 74 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 LRRC74AQ0VAA2 488 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 FBXO43Q4G163 708 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 RNF220Q5VTB9 566 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM22Q8IYM9 498 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 STK32AQ8WU08 396 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ESR2Q92731 530 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 HAUS8Q9BT25 410 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 C12orf4Q9NQ89 552 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 DACT1Q9NYF0 836 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 HPS5Q9UPZ3 1129 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 LAMB2P55268 1798 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 XDHP47989 1333 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 TTLL13PA6NNM8 815 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 OPLAHO14841 1288 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PRMT3O60678 531 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 FKBP9O95302 570 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 SLC4A1P02730 911 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 SERPINB2P05120 415 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF3P17036 446 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PRDX5P30044 214 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 LIFRP42702 1097 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-201ENST00000325897 SKOR1P84550 965 aa5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms