RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411355.1

RNU6-954P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 954, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-954P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-954P-201ENST00000411355 IDI1Q13907 227 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM47CQ5HY64 1035 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 AGBL4Q5VU57 503 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CEP85Q6P2H3 762 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 GGT6Q6P531 493 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 SASS6Q6UVJ0 657 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 NOSTRINQ8IVI9 506 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 MRIQ9BWK5 157 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CDK19Q9BWU1 502 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 PLA2G12BQ9BX93 195 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 AMNQ9BXJ7 453 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CHMP4AQ9BY43 222 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF341Q9BYN7 854 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 GALNT8Q9NY28 637 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 A2ML1A8K2U0 1454 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 USP54Q70EL1 1684 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 DIP2AQ14689 1571 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 MSH6P52701 1360 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 RASSF10A6NK89 507 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CHL1O00533 1208 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CYR61O00622 381 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 SDSP20132 328 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 STAT5BP51692 787 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CD83Q01151 205 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 DUSP8Q13202 625 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 NRN1LQ496H8 165 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC7A14Q8TBB6 771 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CFHR4Q92496 578 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 COG3Q96JB2 828 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 TSPY26PQ9H489 355 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 BABAM1Q9NWV8 329 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 SNTG2Q9NY99 539 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 SIRPGQ9P1W8 387 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 OVOS2Q6IE36 1432 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 GSTA4O15217 222 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 ARHGAP6O43182 974 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 RAD17O75943 681 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 GNAI3P08754 354 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 ECE1P42892 770 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 HERVK_113P62684 666 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 DGCR2P98153 550 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 SERINC3Q13530 473 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 PCOLCEQ15113 449 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 STILQ15468 1287 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 NBPF6Q5VWK0 638 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 KANK2Q63ZY3 851 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 Q6ZSN1 163 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 TSPYL6Q8N831 410 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 ASB15Q8WXK1 588 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 EXTL1Q92935 676 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 WNK4Q96J92 1243 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 SCYL1Q96KG9 808 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 PHACTR3Q96KR7 559 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 NBPF4Q96M43 638 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 BTBD2Q9BX70 525 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 STAP2Q9UGK3 403 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 USP25Q9UHP3 1055 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CRB1P82279 1406 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 KDRP35968 1356 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 UQCRHLA0A096LP55 91 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 GNAI2P04899 355 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 UQCRHP07919 91 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 NAT1P18440 290 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 PDE1AP54750 535 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 MOGSQ13724 837 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMEM132BQ14DG7 1078 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC183Q5T5S1 534 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 500.5 ms