RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 CROCCP2Q86T23 111 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 APPBP2Q92624 585 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PPP2R3CQ969Q6 453 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 C18orf8Q96DM3 657 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MAGEB18Q96M61 343 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ARMC7Q9H6L4 198 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ATP9BO43861 1147 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC22O60826 627 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 HAUS5O94927 633 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ADORA1P30542 326 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PGM1P36871 562 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CDC16Q13042 620 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 IL17AQ16552 155 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ERMNQ8TAM6 284 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 USP33Q8TEY7 942 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 XAGE3Q8WTP9 111 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RSPH1Q8WYR4 309 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 USP40Q9NVE5 1235 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 AIPL1Q9NZN9 384 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 BMP15O95972 392 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SMARCA1P28370 1054 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RPL21P46778 160 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TMED2Q15363 201 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MAN2A1Q16706 1144 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MMEL1Q495T6 779 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 AADACL2Q6P093 401 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 COPS6Q7L5N1 327 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 IQCF2Q8IXL9 164 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 OGFOD1Q8N543 542 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 HIPK4Q8NE63 616 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PPP1R14BQ96C90 147 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 GRAMD1AQ96CP6 724 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 KLHL4Q9C0H6 718 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 UBA5Q9GZZ9 404 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 FBP2O00757 339 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RGL2O15211 777 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 GSC2O15499 205 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ABCB4P21439 1286 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ATP5DP30049 168 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 YARSP54577 528 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SCARF1Q14162 830 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CYTH1Q15438 398 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 DUPD1Q68J44 220 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 FNDC8Q8TC99 324 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC127Q96BQ5 260 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 BTBD10Q9BSF8 475 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TXLNGYQ9BZA5 131 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 DISC1Q9NRI5 854 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ANPEPP15144 967 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SEPT6Q14141 434 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC41Q15345 812 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 USH1GQ495M9 461 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 C6orf163Q5TEZ5 329 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ZDHHC24Q6UX98 284 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC105Q8IYK2 499 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 SNX27Q96L92 541 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC27Q9C0I9 530 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM60Q9H2L4 133 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 STK32BQ9NY57 414 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 AMFRQ9UKV5 643 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 NUB1Q9Y5A7 615 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ACEP12821 1306 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TSPY2A6NKD2 308 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CLPTM1O96005 669 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PDGFRBP09619 1106 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TSPY3P0CV98 308 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TSPY8P0CW00 308 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PCSK6P29122 969 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 ARPC4P59998 168 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 TSPY1Q01534 308 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 MYBPC2Q14324 1141 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 RAPH1Q70E73 1250 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 FANCBQ8NB91 859 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 CLPTM1LQ96KA5 538 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD1-203ENST00000395211 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms