RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 LPPQ93052 612 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 MBD6Q96DN6 1003 aa4.02□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 C7orf25Q9BPX7 421 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 OR10A2Q9H208 303 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 ALDH1A2O94788 518 aa4.01□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 ECHS1P30084 290 aa4.01□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.01□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 ING3Q9NXR8 418 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 TRPS1Q9UHF7 1281 aa4.01□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.01□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 TUSC2O75896 110 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 TOX4O94842 621 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 ALDH2P05091 517 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 MYBP10242 640 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 IL12RB1P42701 662 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 KIR2DL3P43628 341 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 RAP1GAPP47736 663 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 TTC17Q96AE7 1141 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 TMEM60Q9H2L4 133 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 MANSC1Q9H8J5 431 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC16A6O15403 523 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRC-205ENST00000391970 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-205ENST00000391970 NFYCQ13952 458 aa3.99□□□□□ -1.77
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