RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TM6SF1Q9BZW5 370 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SDF2L1Q9HCN8 221 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM39AQ9NV64 488 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TBCCD1Q9NVR7 557 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OGFRQ9NZT2 677 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HDAC6Q9UBN7 1215 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXO10Q9UK96 956 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HGFP14210 728 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PCSK2P16519 638 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCR10P46092 362 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MEOX1P50221 254 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DSCR9P59020 149 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HGFACQ04756 655 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CREB3L3Q68CJ9 461 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TTLL5Q6EMB2 1281 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VASNQ6EMK4 673 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAAP20Q6NZ36 180 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPFIBP1Q86W92 1011 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SULF2Q8IWU5 870 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RFLNBQ8N5W9 214 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MB21D1Q8N884 522 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF248Q8NDW4 579 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FGFBP3Q8TAT2 258 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LPPQ93052 612 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C2orf48Q96LS8 159 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL21RQ9HBE5 538 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCND1Q9NSA2 647 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM248Q9NWD8 314 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PCNX2A6NKB5 2137 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC16A5O15375 505 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FOXO3O43524 673 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SIGLEC6O43699 453 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NTSR2O95665 410 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HMGCRP04035 888 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CTSAP10619 480 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GNAT2P19087 354 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTGER3P43115 390 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LUMP51884 338 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNF4P78317 190 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM189BP81408 668 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PSG6Q00889 435 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FOXF1Q12946 379 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAB33AQ14088 237 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DACT2Q5SW24 774 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 METTL7BQ6UX53 244 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FRRS1Q6ZNA5 592 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TICAM1Q8IUC6 712 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZZZ3Q8IYH5 903 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZPLD1Q8TCW7 415 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ELP5Q8TE02 316 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ST8SIA2Q92186 375 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RUNDC1Q96C34 613 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TCF12Q99081 682 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PCDHA4Q9UN74 947 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NLRC5Q86WI3 1866 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARID1AO14497 2285 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ABCA7Q8IZY2 2146 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FCHO1O14526 889 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SGSM2O43147 1006 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NTRK1P04629 796 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NME2P22392 152 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZAP70P43403 619 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIR3DL2P43630 455 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNNI2P48788 182 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC157Q569K6 752 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WASHC2DQ5SRD0 308 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMC5Q6UXY8 1006 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LILRB2Q8N423 598 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF561Q8N587 486 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MPLKIPQ8TAP9 179 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GLG1Q92896 1179 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MIB2Q96AX9 1013 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM87BQ96K49 555 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FOXN4Q96NZ1 517 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM118BQ9BPY3 351 aa-1.05□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.3 ms