RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.98■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 HIDE1A8MVS5 230 aa18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 CXCL14O95715 111 aa18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 ALADP13716 330 aa18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 NAMPTP43490 491 aa18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 AMHR2Q16671 573 aa18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 CASP10Q92851 521 aa18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 FAN1Q9Y2M0 1017 aa18.97■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 A0A1B0GUA9 196 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 ARL5CA6NH57 179 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 N4BP3O15049 544 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 SLC11A1P49279 550 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 EFNA5P52803 228 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 FAM187BQ17R55 369 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 LLGL2Q6P1M3 1020 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 ZNF280BQ86YH2 543 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 APOL6Q9BWW8 343 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 ZBP1Q9H171 429 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 CD320Q9NPF0 282 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 DNAJB4Q9UDY4 337 aa18.96■□□□□ 0.63
USP11-202ENST00000377078 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 C2orf71A6NGG8 1288 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 B4GALT5O43286 388 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 NPTXRO95502 500 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 CTSAP10619 480 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 MLH1P40692 756 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 RPS6KC1Q96S38 1066 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 GAD1Q99259 594 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 FZD8Q9H461 694 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 EPHX3Q9H6B9 360 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 HES2Q9Y543 173 aa18.95■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 C19orf67A6NJJ6 358 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 PI4K2BG5E9Z4 385 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 INPPL1O15357 1258 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 DDHD2O94830 711 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 PRKCBP05771 671 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 ECM1Q16610 540 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 TMEM31Q5JXX7 168 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 ANKRD54Q6NXT1 300 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 KCTD17Q8N5Z5 321 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 VN1R2Q8NFZ6 395 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 DRC1Q96MC2 740 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 RNF39Q9H2S5 420 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 PARP2Q9UGN5 583 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 IRAK3Q9Y616 596 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa18.94■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 ACKR2O00590 384 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 NRP1O14786 923 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 BMP15O95972 392 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 LIG1P18858 919 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 PDCP20941 246 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 OR1G1P47890 313 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 SCNN1GP51170 649 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 BRAPQ7Z569 592 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 PPFIBP1Q86W92 1011 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 ZFP42Q96MM3 310 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 NT5C3AQ9H0P0 336 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 DZANK1Q9NVP4 752 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 C5orf42Q9H799 3197 aa18.93■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 DCXO43602 365 aa18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 AKAP5P24588 427 aa18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 GRIK3Q13003 919 aa18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 KCNC3Q14003 757 aa18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 CES5AQ6NT32 575 aa18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 COLGALT2Q8IYK4 626 aa18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 BSNDQ8WZ55 320 aa18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 TIPINQ9BVW5 301 aa18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
USP11-202ENST00000377078 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.1 ms