RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEC23AQ15436 765 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPDYE7PQ495Y7 208 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 GFI1BQ5VTD9 330 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 BTNL9Q6UXG8 535 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 OSTM1Q86WC4 334 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 XYLT1Q86Y38 959 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR10H5Q8NGA6 315 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 DYDC2Q96IM9 177 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 AIFM2Q9BRQ8 373 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 IER2Q9BTL4 223 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRMOQ9BU70 441 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 CATSPERZQ9NTU4 200 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM260Q9NX78 707 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAI1Q9UI46 699 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOTCH3Q9UM47 2321 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 RASSF10A6NK89 507 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNK3O14649 394 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 ORC4O43929 436 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUSD5O60279 629 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBP3P10745 1247 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 MMP13P45452 471 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM25P49756 843 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SOX10P56693 466 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 JAM2P57087 298 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP2R2AP63151 447 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 TFF2Q03403 129 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEMA3AQ14563 771 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSTD2Q5T7W7 516 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 AMIGO2Q86SJ2 522 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR5M3Q8NGP4 307 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL17RAQ96F46 866 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHDQ96IW2 340 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYZL4Q96KX0 146 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXB1Q99853 325 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 DMTF1Q9Y222 760 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOX1Q9Y5S8 564 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCDO00767 359 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 LATS1O95835 1130 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 ALPLP05186 524 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 PYGMP11217 842 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 MGAT1P26572 445 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 CERS1P27544 350 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 MPGP29372 298 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 CASRP41180 1078 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 RHDQ02161 417 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 NTRK3Q16288 839 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRY1Q16526 586 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 PXDC1Q5TGL8 231 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 STYK1Q6J9G0 422 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPNTQ6UXI9 565 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXW5Q969U6 566 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM79Q9BSE2 394 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTFR1LQ9H019 292 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 VPS16Q9H269 839 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 ING3Q9NXR8 418 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCTD5Q9NXV2 234 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCMF1Q9P0J7 381 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 POGKQ9P215 609 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 CBLCQ9ULV8 474 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOTCH2Q04721 2471 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOTCH4Q99466 2003 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM90A10PA6NDY2 464 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 RASGRP1O95267 797 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCP2P22307 547 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SDHAP31040 664 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGS3P49796 1198 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 GZMKP49863 264 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP10-3P60369 221 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNA1Q09470 495 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAK1Q13153 545 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 RABEP1Q15276 862 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRC41Q15345 812 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM119Q4V9L6 283 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC44A4Q53GD3 710 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 TM4SF20Q53R12 229 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 BSPRYQ5W0U4 402 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 METRNLQ641Q3 311 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC18B1Q6NT16 456 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC2A7Q6PXP3 512 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.1 ms