RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 CAMK1Q14012 370 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 AAK1Q2M2I8 961 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 PADI6Q6TGC4 694 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 CHST12Q9NRB3 414 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 MYO7AQ13402 2215 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ITGB1P05556 798 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 GUCY2CP25092 1073 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 CASD1Q96PB1 797 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 NCOR1O75376 2440 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ARID2Q68CP9 1835 aa20.12■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 DGAT1O75907 488 aa20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 SMC2O95347 1197 aa20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 DNAJB1P25685 340 aa20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 TCP11Q8WWU5 503 aa20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 CWH43Q9H720 699 aa20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 HOXA2O43364 376 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 KLRC4O43908 158 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 GIT2Q14161 759 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 DYMQ7RTS9 669 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 RNF169Q8NCN4 708 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 SMARCE1Q969G3 411 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 GSDMAQ96QA5 445 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 TIPINQ9BVW5 301 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ASAP2O43150 1006 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 EOMESO95936 686 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 PHKA2P46019 1235 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ASIC1P78348 528 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 COL19A1Q14993 1142 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 UNC13DQ70J99 1090 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 RNF149Q8NC42 400 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 REEP2Q9BRK0 252 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.1■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 SYCE3A1L190 88 aa20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 CSPG5O95196 566 aa20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 ARL2P36404 184 aa20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 KCNB1Q14721 858 aa20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 POF1BQ8WVV4 589 aa20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 AAASQ9NRG9 546 aa20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.09■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 C5orf42Q9H799 3197 aa20.08■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 ZNF131P52739 623 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 MAPK7Q13164 816 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 ABI1Q8IZP0 508 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 DAW1Q8N136 415 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 LRRC43Q8N309 656 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 HELQQ8TDG4 1101 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 RMND1Q9NWS8 449 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.08■□□□□ 0.8
PTX4-201ENST00000293922 RHOBTB3O94955 611 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms