RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264938.7

SLC9A3-201, Transcript of solute carrier family 9 member A3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC9A3, Length 2,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3-201ENST00000264938 RAD23BP54727 409 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 COG2Q14746 738 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 MTFR1Q15390 333 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 KSR1Q8IVT5 923 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 BCS1LQ9Y276 419 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ABCA3Q99758 1704 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ANKRD33BA6NCL7 494 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 PDHA1P08559 390 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 TRIM49P0CI25 452 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 TRIM49CP0CI26 452 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 CALB2P22676 271 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 CYP1B1Q16678 543 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 KYNUQ16719 465 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 DNM3Q9UQ16 869 aa24.93■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 TAC1P20366 129 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 GNPTABQ3T906 1256 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 PASKQ96RG2 1323 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 TTLL1O95922 423 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 TPBGLP0DKB5 382 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 CHRNB2P17787 502 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 TARSP26639 723 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 CALCOCO2Q13137 446 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 SNX1Q13596 522 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 BTBD6Q96KE9 485 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 MAGEB18Q96M61 343 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 PWWP2AQ96N64 755 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 HAO1Q9UJM8 370 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 USP17L10C9JJH3 530 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 FESP07332 822 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 GSTO1P78417 241 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 TEX9Q8N6V9 391 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 AGPAT1Q99943 283 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 SNHG28P0DPA3 235 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 CYP4A11Q02928 519 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 FAM13CQ8NE31 585 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ERP27Q96DN0 273 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 SYT15Q9BQS2 421 aa24.91■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 FBF1Q8TES7 1133 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 STK32AQ8WU08 396 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 PITPNM3Q9BZ71 974 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 DNAJC18Q9H819 358 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 PIDD1Q9HB75 910 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 APEX2Q9UBZ4 518 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC15Q0P6D6 951 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 C1orf54Q8WWF1 131 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 PCK1P35558 622 aa24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF543Q08ER8 600 aa24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ACVR2BQ13705 512 aa24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 LRMDAQ9H2I8 198 aa24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 TXLNGQ9NUQ3 528 aa24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 ETAA1Q9NY74 926 aa24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 CHKBQ9Y259 395 aa24.89■■□□□ 1.58
SLC9A3-201ENST00000264938 NHSQ6T4R5 1651 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 H0Y3Z8 333 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 AHCYL1O43865 530 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 ECEL1O95672 775 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 GGPS1O95749 300 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 TTC4O95801 387 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 PARP6Q2NL67 630 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 RHBDF2Q6PJF5 856 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 VSIG1Q86XK7 387 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 CNBD1Q8NA66 436 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.89■■□□□ 1.57
SLC9A3-201ENST00000264938 CD101Q93033 1021 aa24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms