RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251775.8

SNX4-201, Transcript of sorting nexin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX4, Length 2,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4-201ENST00000251775 INTUQ9ULD6 942 aa20.4■□□□□ 0.86
SNX4-201ENST00000251775 L3MBTL1Q9Y468 752 aa20.4■□□□□ 0.86
SNX4-201ENST00000251775 TLDC2A0PJX2 215 aa20.4■□□□□ 0.86
SNX4-201ENST00000251775 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SNX4-201ENST00000251775 CFAP73A6NFT4 308 aa20.4■□□□□ 0.86
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SNX4-201ENST00000251775 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.37■□□□□ 0.85
SNX4-201ENST00000251775 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.37■□□□□ 0.85
SNX4-201ENST00000251775 FEM1BQ9UK73 627 aa20.37■□□□□ 0.85
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SNX4-201ENST00000251775 CYP2J2P51589 502 aa20.36■□□□□ 0.85
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SNX4-201ENST00000251775 COL20A1Q9P218 1284 aa20.36■□□□□ 0.85
SNX4-201ENST00000251775 FAM187AA6NFU0 413 aa20.35■□□□□ 0.85
SNX4-201ENST00000251775 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SNX4-201ENST00000251775 UBOX5O94941 541 aa20.35■□□□□ 0.85
SNX4-201ENST00000251775 AGTP01019 485 aa20.35■□□□□ 0.85
SNX4-201ENST00000251775 RARAP10276 462 aa20.35■□□□□ 0.85
SNX4-201ENST00000251775 NQO1P15559 274 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SNX4-201ENST00000251775 CBWD6Q4V339 395 aa20.35■□□□□ 0.85
SNX4-201ENST00000251775 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.35■□□□□ 0.85
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