RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 B3GALT2O43825 422 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 DGKIO75912 1065 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ALDH2P05091 517 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 LPLP06858 475 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP27A1Q02318 531 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 LMOD3Q0VAK6 560 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 CATSPEREQ5SY80 951 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 C20orf194Q5TEA3 1177 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC62Q6P9F0 684 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF354CQ86Y25 554 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXL6Q8N531 539 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHF1Q96S99 279 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 LRFN3Q9BTN0 628 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 APOL5Q9BWW9 433 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 STOML1Q9UBI4 398 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PIK3R4Q99570 1358 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PEAK1Q9H792 1746 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKARQ7Z5J8 1434 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS38A1L453 326 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM90A27PA6NNH2 459 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 BCAR3O75815 825 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 FUCA1P04066 466 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 BDNFP23560 247 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 LTKP29376 864 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 SDHAP31040 664 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 FNTBP49356 437 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RARSP54136 660 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 NFIAQ12857 509 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 MUM1Q2TAK8 710 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PGS1Q32NB8 556 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ALFQ53S48 1182 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF220Q5VTB9 566 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 NPNTQ6UXI9 565 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 NME9Q86XW9 330 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 SCLT1Q96NL6 688 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 MTA3Q9BTC8 594 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ANP32EQ9BTT0 268 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.614e-11■□□□□ 10.6
CAPNS1-210ENST00000590211 POLKQ9UBT6 870 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 FBLN5Q9UBX5 448 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 LTN1O94822 1766 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC21AQ8NDW8 1320 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 FADS2P1A8MWK0 482 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RASA4BC9J798 803 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLIM4O00461 696 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 KRIT1O00522 736 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RASA4O43374 803 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ITGB2P05107 769 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 MTHFD2P13995 350 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 EDNRBP24530 442 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKAR2BP31323 418 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RENBPP51606 427 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC5A3P53794 718 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 RIPK4P57078 832 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 DUSP4Q13115 394 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM14Q14142 442 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC9A5Q14940 896 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 MROH9Q5TGP6 573 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR78Q5VTH9 848 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-210ENST00000590211 KCTD1Q719H9 257 aa4.98□□□□□ -1.61
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