RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516171.1

RNU6-436P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 436, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-436P, Length 114 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-436P-201ENST00000516171 CRAMP1Q96RY5 1269 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 AGAP2Q99490 1192 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 ORAI3Q9BRQ5 295 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 TRPS1Q9UHF7 1281 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 PRSS38A1L453 326 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 MTSS1O43312 755 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 TGM5O43548 720 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 DNAJC6O75061 913 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 RAB11FIP3O75154 756 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 LY86O95711 162 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 GCP02774 474 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 KRT4P19013 534 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 LSP1P33241 339 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 DSG1Q02413 1049 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 DUSP2Q05923 314 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 TIGD2Q4W5G0 525 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 LY6G5CQ5SRR4 150 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 LMBR1LQ6UX01 489 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 C16orf86Q6ZW13 317 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 HTR3DQ70Z44 454 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 AHI1Q8N157 1196 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 CDYL2Q8N8U2 506 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 PIK3C3Q8NEB9 887 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 PROKR1Q8TCW9 393 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 UBXN4Q92575 508 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 APPBP2Q92624 585 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 NINJ1Q92982 152 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 ANO3Q9BYT9 981 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 FANCLQ9NW38 375 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 FZD1Q9UP38 647 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 LCHNA4D1U4 455 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 NRP2O60462 931 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 PPFIA4O75335 1185 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 RHOBTB3O94955 611 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 ABHD16AO95870 558 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 ITGB1P05556 798 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 PFKMP08237 780 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 CLEC2LP0C7M8 214 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 BMP5P22003 454 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 GZMKP49863 264 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 NRG3P56975 720 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 IL2P60568 153 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 OCRLQ01968 901 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 MGAT5Q09328 741 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 UBE3CQ15386 1083 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 TKFCQ3LXA3 575 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 KCNV1Q6PIU1 500 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 Q6ZPA2 131 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 FRMD7Q6ZUT3 714 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 TAS1R1Q7RTX1 841 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 C11orf74Q86VG3 221 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 ZNF575Q86XF7 245 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 XYLT1Q86Y38 959 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 NIM1KQ8IY84 436 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 UNC5BQ8IZJ1 945 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 ZNF610Q8N9Z0 462 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 SMC1BQ8NDV3 1235 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 GPR150Q8NGU9 434 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 LENG9Q96B70 501 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 IL17RAQ96F46 866 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 PDCD2LQ9BRP1 358 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 PIF1Q9H611 641 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 SPON1Q9HCB6 807 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 SPTLC3Q9NUV7 552 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 NUMBLQ9Y6R0 609 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-436P-201ENST00000516171 COL4A3Q01955 1670 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 FAM83GA6ND36 823 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 GRXCR1A8MXD5 290 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 CFBP00751 764 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 GYPEP15421 78 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 LAG3P18627 525 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 NR4A1P22736 598 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 GPR15P49685 360 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 PTTG1IPP53801 180 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 PHC1P78364 1004 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 TERF2Q15554 542 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 VPS72Q15906 364 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 METTL24Q5JXM2 366 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 GPR158Q5T848 1215 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 BROXQ5VW32 411 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-436P-201ENST00000516171 IQSEC1Q6DN90 963 aa2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms