RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 PIGOQ8TEQ8 1089 aa29.66■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 EPHX3Q9H6B9 360 aa29.66■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 UBN1Q9NPG3 1134 aa29.66■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 TBC1D13Q9NVG8 400 aa29.66■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 KANSL3Q9P2N6 904 aa29.66■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP29.65■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 RPA1P27694 616 aa29.65■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 HAUS3Q68CZ6 603 aa29.65■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 NOTUMQ6P988 496 aa29.65■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 RSAD1Q9HA92 442 aa29.65■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 STK39Q9UEW8 545 aa29.65■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 PER2O15055 1255 aa29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 ALADP13716 330 aa29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 NCLP19338 710 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 CAPSQ13938 189 aa29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 UBXN11Q5T124 520 aa29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 AGMOQ6ZNB7 445 aa29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 ASAP3Q8TDY4 903 aa29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 STK24Q9Y6E0 443 aa29.64■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 MEIS3P2A8K0S8 358 aa29.63■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 TSPAN1O60635 241 aa29.63■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 USO1O60763 962 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 MED24O75448 989 aa29.63■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 GLRA2P23416 452 aa29.63■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 LONRF3Q496Y0 759 aa29.63■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa29.63■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.336e-10■□□□□ 10.1
ODC1-204ENST00000446285 MBTD1Q05BQ5 628 aa29.62■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 C5orf42Q9H799 3197 aa29.62■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 GALTP07902 379 aa29.61■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 KCNC3Q14003 757 aa29.61■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 GIT2Q14161 759 aa29.61■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 TMEM31Q5JXX7 168 aa29.61■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 HACE1Q8IYU2 909 aa29.61■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 IGSF21Q96ID5 467 aa29.61■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 TMEM175Q9BSA9 504 aa29.61■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 RAB34Q9BZG1 259 aa29.61■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 CSRNP2Q9H175 543 aa29.61■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 HIDE1A8MVS5 230 aa29.6■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 GPR37L1O60883 481 aa29.6■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 ITGA4P13612 1032 aa29.6■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 COL9A1P20849 921 aa29.6■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 MCM2P49736 904 aa29.6■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 VN1R2Q8NFZ6 395 aa29.6■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 C2orf71A6NGG8 1288 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 LAD1O00515 517 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 PDIA5Q14554 519 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 AMHR2Q16671 573 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 POTEGQ6S5H5 508 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 C4orf32Q8N8J7 132 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 CASP10Q92851 521 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 PRIMPOLQ96LW4 560 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 ZBP1Q9H171 429 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 IPPQ9Y573 584 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 IRAK3Q9Y616 596 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF35A5YM69 484 aa29.58■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 INPPL1O15357 1258 aa29.58■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa29.58■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 VPS52Q8N1B4 723 aa29.58■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 C2orf40Q9H1Z8 148 aa29.58■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
ODC1-204ENST00000446285 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 A0A087WWV3 80 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 DCXO43602 365 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 CYP11B2P19099 503 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD54Q6NXT1 300 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 PADI6Q6TGC4 694 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 CPB2Q96IY4 423 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 GBP3Q9H0R5 595 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 LRWD1Q9UFC0 647 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 LRRIQ4A6NIV6 560 aa29.56■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 ALDH2P05091 517 aa29.56■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 CTSAP10619 480 aa29.56■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 SLC11A1P49279 550 aa29.56■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 TMX3Q96JJ7 454 aa29.56■■■□□ 2.32
ODC1-204ENST00000446285 LRFN3Q9BTN0 628 aa29.56■■■□□ 2.32
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