RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 SV2BQ7L1I2 683 aa20.19■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 SCLT1Q96NL6 688 aa20.19■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.19■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 A0A087WWV3 80 aa20.19■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 POSTNQ15063 836 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 CAMK4Q16566 473 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 PTPROQ16827 1216 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 KSR1Q8IVT5 923 aa20.18■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 COG5Q9UP83 839 aa20.18■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 STAMQ92783 540 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.17■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 PLVAPQ9BX97 442 aa20.17■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 XKR9Q5GH70 373 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 HLA-CQ95604 372 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 TMEM143Q96AN5 459 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 TRIM9Q9C026 710 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.16■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 MYMKA6NI61 221 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 DPYDQ12882 1025 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 PNOCQ13519 176 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 ARSHQ5FYA8 562 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 GPBP1Q86WP2 473 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 SPATA20Q8TB22 786 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 P2RX5Q93086 422 aa20.15■□□□□ 0.82
PTX4-201ENST00000293922 NLRP4Q96MN2 994 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTX4-201ENST00000293922 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
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PTX4-201ENST00000293922 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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PTX4-201ENST00000293922 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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PTX4-201ENST00000293922 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 HCSTQ9UBK5 93 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.14■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 A0A0U1RQF3 1178 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 BMP1P13497 986 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 CASP1P29466 404 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 KCNQ1P51787 676 aa20.13■□□□□ 0.81
PTX4-201ENST00000293922 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.13■□□□□ 0.81
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