RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 RAPH1Q70E73 1250 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 C19orf81C9J6K1 198 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 DGAT1O75907 488 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 CALB1P05937 261 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 RFX1P22670 979 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 XKR3Q5GH77 459 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 GGA3Q9NZ52 723 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE4BO95155 1302 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PFDN6O15212 129 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 MT-ND3P03897 115 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPAQ15257 358 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ESYT3A0FGR9 886 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC15A2Q16348 729 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 GGPS1O95749 300 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 CENPUQ71F23 418 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOC4Q96A65 974 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 HUS1O60921 280 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 RPA1P27694 616 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 RFFLQ8WZ73 363 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1B0GUA9 196 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 COPB2P35606 906 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 VCX3BQ9H321 246 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 SPON1Q9HCB6 807 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 ASB14A6NK59 587 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 CLTAP09496 248 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 BEST2Q8NFU1 509 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.132e-6■■□□□ 12.1
PTPRJ-208ENST00000615445 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 MYBP10242 640 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM143Q96AN5 459 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 PLAAQ9Y263 795 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 TFDP2Q14188 446 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP8B3O60423 1300 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 EFNA5P52803 228 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP26A1O43174 497 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 SEC23AQ15436 765 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 TC2NQ8N9U0 490 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 GINM1Q9NU53 330 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 CA4P22748 312 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 SLIT1O75093 1534 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 M0QYV0 167 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 UCHL3P15374 230 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 TIPINQ9BVW5 301 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 GYS2P54840 703 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 PCGF5Q86SE9 256 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-208ENST00000615445 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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