RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF384Q8TF68 577 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DLG3Q92796 817 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DUSP26Q9BV47 211 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRVI1Q9Y6F6 885 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC66A2RUB6 948 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IQCA1LA6NCM1 817 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCDO00767 359 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RECKO95980 971 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIR2DL3P43628 341 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GUCY1B3Q02153 619 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SH2D3CQ8N5H7 860 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR92Q96MX6 357 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ENKD1Q9H0I2 346 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRAV20A0A0B4J274 112 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PROP1O75360 226 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NDUFA10O95299 355 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MPP3Q13368 585 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM47CQ5HY64 1035 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CATSPEREQ5SY80 951 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FSTL4Q6MZW2 842 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NT5DC4Q86YG4 428 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HAPLN2Q9GZV7 340 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NCDNQ9UBB6 729 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAST3O60307 1309 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DAPK3O43293 454 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RASGRP1O95267 797 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NAT1P18440 290 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VAMP1P23763 118 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KLHL22Q53GT1 634 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM83AQ86UY5 434 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTPRN2Q92932 1015 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCMF1Q9P0J7 381 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRC3CA6NJW4 275 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DIRC3C9JPN6 131 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNAJC6O75061 913 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ETFBP38117 255 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNM2P50570 870 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GUCY1A3Q02108 690 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ASB10Q8WXI3 467 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DYDC2Q96IM9 177 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADAM2Q99965 735 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM38O00635 465 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRLP01236 227 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CBSLP0DN79 551 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CBSP35520 551 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RGS3P49796 1198 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ROM1Q03395 351 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TP53BP2Q13625 1128 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DOK3Q7L591 496 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 E2F7Q96AV8 911 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIAA1586Q9HCI6 787 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SALL3Q9BXA9 1300 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UNC119BA6NIH7 251 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LEFTY2O00292 366 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RARRES1P49788 294 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CACNA2D1P54289 1103 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OCA2Q04671 838 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM132BQ14DG7 1078 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DDB1Q16531 1140 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARHGEF25Q86VW2 580 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TGIF2Q9GZN2 237 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACBD3Q9H3P7 528 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACSS2Q9NR19 701 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms