RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF568Q3ZCX4 644 aa17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHOBTB3O94955 611 aa17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPUQ71F23 418 aa17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STXBP3O00186 592 aa17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLS3P13797 630 aa17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC8A1P32418 973 aa17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT39Q6A163 491 aa17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCINQ9Y6U3 715 aa17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GARSP41250 739 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO33Q7Z6M2 555 aa17.75■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa17.75■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf54Q8WWF1 131 aa17.75■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HDAC11Q96DB2 347 aa17.75■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM59Q8IWR1 403 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 REEP2Q9BRK0 252 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLPH3Q9H4A6 298 aa17.74■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OPHN1O60890 802 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IREB2P48200 963 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADCY2Q08462 1091 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF699Q32M78 642 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABI1Q8IZP0 508 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.431e-7■■■□□ 16.2
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP26A1O43174 497 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASA4O43374 803 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LDHAP00338 332 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HMGCS2P54868 508 aa17.74■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MMEL1Q495T6 779 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHPN2Q8IUC4 686 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIPOL1Q8TD10 442 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC10A4Q96EP9 437 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEL1LQ9UBV2 794 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FMN2Q9NZ56 1722 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC9A1P19634 815 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNS2Q63HR2 1409 aa17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa17.74■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC17Q96AE7 1141 aa17.74■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TJP3O95049 919 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EYA4O95677 639 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMC5P62195 406 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC14Q15048 493 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH2D3CQ8N5H7 860 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PITPNM3Q9BZ71 974 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFT122Q9HBG6 1241 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INTUQ9ULD6 942 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASGRP2Q7LDG7 609 aa17.73■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAML1Q92585 1016 aa17.73■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC30A5Q8TAD4 765 aa17.72■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXL5Q9UKA1 691 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPAQ15257 358 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMCO4Q5TGY1 634 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RFFLQ8WZ73 363 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0G2JND7 137 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UCHL3P15374 230 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOX5P35711 763 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARMC9Q7Z3E5 817 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO3BQ8WXR4 1341 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDXKO00764 312 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNA15P30679 374 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPHA7Q15375 998 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXL13Q8NEE6 735 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAF2Q96CS3 445 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HAUS2Q9NVX0 235 aa17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYBP10242 640 aa17.71■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SURF1Q15526 300 aa17.71■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DBN1Q16643 649 aa17.71■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
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