RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	B4GALT3	O60512	393 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMD10	O75832	226 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	TDP2	O95551	362 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	BCAR1	P56945	870 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT17	Q04695	432 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	MTERF2	Q49AM1	385 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	CASP10	Q92851	521 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	LPP	Q93052	612 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-233	ENST00000602338	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.45	□□□□□ -0.26	2e-9	■□□□□ 8.9
TTLL3-233	ENST00000602338	BRD1	O95696	1058 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	EOMES	O95936	686 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	IFNAR1	P17181	557 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	AVPR2	P30518	371 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SFN	P31947	248 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	HSPA4	P34932	840 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	PHKA2	P46019	1235 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	JAK3	P52333	1124 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TBCK	Q8TEA7	893 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	PRRX2	Q99811	253 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WZ62	844 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ASGR2	P07307	311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	EPCAM	P16422	314 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	CA8	P35219	290 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	USP11	P51784	963 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	NPY5R	Q15761	445 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	NR2E1	Q9Y466	385 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338		M0R2N6	131 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	EVC	P57679	992 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ITIH3	Q06033	890 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338		Q4G0T1	1027 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	XKR3	Q5GH77	459 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ANO5	Q75V66	913 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	IGSF21	Q96ID5	467 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338		H0Y858	1186 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC37A4	O43826	429 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	CXCL14	O95715	111 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	CTSA	P10619	480 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26

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