RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP17A1P05093 508 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SETSIPP0DME0 302 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CD40P25942 277 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SPIRE1Q08AE8 756 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 STK3Q13188 491 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT72Q14CN4 511 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 LONRF1Q17RB8 773 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TOR2AQ5JU69 321 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CPZQ66K79 652 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ZPBP2Q6X784 338 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 DLG3Q92796 817 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ACSS2Q9NR19 701 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 BTG4Q9NY30 223 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ADGRE2Q9UHX3 823 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC7Q96NW7 1537 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 DLG5Q8TDM6 1919 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 FYB1O15117 783 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 NBNO60934 754 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 HIP1RO75146 1068 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFS2O75306 463 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TUSC2O75896 110 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 OSMP13725 252 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ENPP1P22413 925 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 MOGSQ13724 837 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC23AQ15436 765 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CT83Q5H943 113 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNK18Q7Z418 384 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR63Q8IWG1 891 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 Q8N1Y9 231 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 NME8Q8N427 588 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K14Q99558 947 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 MSRAQ9UJ68 235 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 RAXQ9Y2V3 346 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 PTCH1Q13635 1447 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 USP54Q70EL1 1684 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 F5H423 210 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ESR1P03372 595 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TYRP1P17643 537 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 PDCP20941 246 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 FPR2P25090 351 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TM4SF4P48230 202 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TEKQ02763 1124 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 SEMA5AQ13591 1074 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP27C1Q4G0S4 372 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP2R1Q6VVX0 501 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 WAPLQ7Z5K2 1190 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CD163Q86VB7 1156 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 CPXCR1Q8N123 301 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 TCP11L2Q8N4U5 519 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 NAT16Q8N8M0 369 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM181AQ8N9Y4 354 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-210ENST00000590211 MVB12AQ96EY5 273 aa5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms