RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 SLITRK3O94933 977 aa28.13■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 LRCH2Q5VUJ6 765 aa28.13■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 SLC5A5Q92911 643 aa28.13■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 GH2P01242 217 aa28.13■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 CCDC172P0C7W6 258 aa28.13■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.093e-6■□□□□ 10.3
OPN3-204ENST00000469376 NT5DC3Q86UY8 548 aa28.13■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 DYDC2Q96IM9 177 aa28.13■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TEPSINQ96N21 525 aa28.13■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 F8VZ95 297 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 SART1O43290 800 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 EVI5O60447 810 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 FMO5P49326 533 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 ZNF131P52739 623 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 PPP2R5AQ15172 486 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 GJB7Q6PEY0 223 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 HS2ST1Q7LGA3 356 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 SH2D3CQ8N5H7 860 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 PIGOQ8TEQ8 1089 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 HES6Q96HZ4 224 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 WDR18Q9BV38 432 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 GOLPH3Q9H4A6 298 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 EHMT1Q9H9B1 1298 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 PLAAQ9Y263 795 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 KRIT1O00522 736 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TBC1D12O60347 775 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TMEM253P0C7T8 217 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 NR1D1P20393 614 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 ECHS1P30084 290 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 NMT1P30419 496 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 KCTD16Q68DU8 428 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 DAAM2Q86T65 1068 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TPH2Q8IWU9 490 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 AMFRQ9UKV5 643 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 ODF2LQ9ULJ1 636 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 STAT2P52630 851 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 GALCP54803 685 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 PDCLQ13371 301 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TRADDQ15628 312 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 CCDC26Q8TAB7 109 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 BCAS3Q9H6U6 928 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 DMAC2Q9NW81 257 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 GOLGA6L10A6NI86 522 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 SFI1A8K8P3 1242 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 MIGA2Q7L4E1 593 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 MAATS1Q7Z4T9 603 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 RFFLQ8WZ73 363 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 NACC1Q96RE7 527 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 CPP00450 1065 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 EPHX2P34913 555 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 MTMR3Q13615 1198 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 ZNF720Q7Z2F6 126 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 OLIG1Q8TAK6 271 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TMBIM4Q9HC24 238 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 DNAJC12Q9UKB3 198 aa28.1■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 POLR2MP0CAP2 368 aa28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 JAG1P78504 1218 aa28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 MAP3K10Q02779 954 aa28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 FIZ1Q96SL8 496 aa28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 SYT11Q9BT88 431 aa28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 AP1M1Q9BXS5 423 aa28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 WDR11Q9BZH6 1224 aa28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa28.09■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 A0A1W2PRG0 241 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 RFX1P22670 979 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 DNAAF5Q86Y56 855 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 FAM178BQ8IXR5 827 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 POLD4Q9HCU8 107 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 FAM169AQ9Y6X4 670 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 GAS7O60861 476 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 HSD17B3P37058 310 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 ATP1A2P50993 1020 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 MYBPC2Q14324 1141 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 CEP85LQ5SZL2 805 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 SLC9A9Q8IVB4 645 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 SEC14L1Q92503 715 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa28.08■■■□□ 2.09
OPN3-204ENST00000469376 IQCA1LA6NCM1 817 aa28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms