RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP3K10Q02779 954 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 ADCY2Q08462 1091 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 MOGSQ13724 837 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.95□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 THAP2Q9H0W7 228 aa3.95□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 KRT79Q5XKE5 535 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS9BPQ6ZS82 235 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 H2AFVQ71UI9 128 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1328Q86T90 577 aa3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP3.94□□□□□ -1.781e-7■■■■■ 29.8
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PGGT1B-203ENST00000419445 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 PNMA2Q9UL42 364 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 GZMAP12544 262 aa3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1B-203ENST00000419445 AP3B2Q13367 1082 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 CNGA2Q16280 664 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC16BQ96JE7 1060 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXO6A8MYZ6 492 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 CHUKO15111 745 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS20O76081 388 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFB10O96000 172 aa3.94□□□□□ -1.78
PGGT1B-203ENST00000419445 INPP5BP32019 993 aa3.94□□□□□ -1.78
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