RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 FAM167AQ96KS9 214 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NACC1Q96RE7 527 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PRR36Q9H6K5 1346 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 KIF13BQ9NQT8 1826 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 IQSEC2Q5JU85 1478 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MYO1FO00160 1098 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MFAP3LO75121 409 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FAM107AO95990 144 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 MMEL1Q495T6 779 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 MTHFD1LQ6UB35 978 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NLRP9Q7RTR0 991 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TADA1Q96BN2 335 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 IL10P22301 178 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 ADCY8P40145 1251 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 APOEP02649 317 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FBLN1P23142 703 aa5.23□□□□□ -1.57
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