RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315423.11

TNIP2-201, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP2, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2-201ENST00000315423 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 IWS1Q96ST2 819 aa27.37■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 ANKEF1Q9NU02 776 aa27.37■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 PSD3Q9NYI0 1048 aa27.37■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 DNAJC12Q9UKB3 198 aa27.37■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 HPCAL4Q9UM19 191 aa27.37■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 LMNB1P20700 586 aa27.36■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 NPEPPSP55786 919 aa27.36■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 BACE1P56817 501 aa27.36■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 GTF2BQ00403 316 aa27.36■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 DGKZQ13574 1117 aa27.36■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 SLC30A5Q8TAD4 765 aa27.36■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 EXOC4Q96A65 974 aa27.36■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa27.36■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 ARID2Q68CP9 1835 aa27.36■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.974e-10■■■□□ 16.1
TNIP2-201ENST00000315423 TRIM49P0CI25 452 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 TRIM49CP0CI26 452 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 OAZ1P54368 228 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 C8orf74Q6P047 294 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 OLIG1Q8TAK6 271 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 SELENOOQ9BVL4 669 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 MYBL2P10244 700 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 LMBR1Q8WVP7 490 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 C12orf42Q96LP6 360 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 SYT11Q9BT88 431 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 EHD2Q9NZN4 543 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.34■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 NCKAP1LP55160 1127 aa27.34■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 ARHGEF16Q5VV41 709 aa27.34■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 TAF4BQ92750 862 aa27.34■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 GPRASP2Q96D09 838 aa27.34■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 SENP7Q9BQF6 1050 aa27.34■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 GPR88Q9GZN0 384 aa27.34■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa27.34■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa27.34■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 ZMYND10O75800 440 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 RPS6KA1Q15418 735 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 TPCN2Q8NHX9 752 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 HVCN1Q96D96 273 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 PBKQ96KB5 322 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 MAF1Q9H063 256 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 RNF146Q9NTX7 359 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 NCANO14594 1321 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 PMM2O15305 246 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 MAFGO15525 162 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 KIF4AO95239 1232 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 CCND2P30279 289 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 UGCGQ16739 394 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 SAMD7Q7Z3H4 446 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 HAUS6Q7Z4H7 955 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 SLFN11Q7Z7L1 901 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 LMO3Q8TAP4 145 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 CCDC102AQ96A19 550 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 ATG4CQ96DT6 458 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 MS4A14Q96JA4 679 aa27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TNIP2-201ENST00000315423 FZD9O00144 591 aa27.32■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 CETN1Q12798 172 aa27.32■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 SYCE1Q8N0S2 351 aa27.32■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 XXYLT1Q8NBI6 393 aa27.32■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 ZNF280CQ8ND82 737 aa27.32■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 REPS2Q8NFH8 660 aa27.32■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 HDAC7Q8WUI4 952 aa27.32■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 ADAM21Q9UKJ8 722 aa27.32■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 BACH1O14867 736 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 CCNE2O96020 404 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 EPHB4P54760 987 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 KIF22Q14807 665 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 EMBQ6PCB8 327 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 NSMFQ6X4W1 530 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 ATP9AO75110 1047 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 NOP2P46087 812 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 VAMP7P51809 220 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 MAEAQ7L5Y9 396 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 VSIG10LQ86VR7 867 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 PICK1Q9NRD5 415 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 USP20Q9Y2K6 914 aa27.31■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 PTPRAP18433 802 aa27.3■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 PLS1Q14651 629 aa27.3■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 USP38Q8NB14 1042 aa27.3■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.3■■□□□ 1.96
TNIP2-201ENST00000315423 HSPBP1Q9NZL4 362 aa27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms