RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GGNQ86UU5 652 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CSRNP2Q9H175 543 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NOTCH1P46531 2555 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SUSD5O60279 629 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PROCP04070 461 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 THBS1P07996 1170 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ITGB2P05107 769 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BAG6P46379 1132 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IFFO2Q5TF58 517 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NAA40Q86UY6 237 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MICALL1Q8N3F8 863 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MUC6Q6W4X9 2439 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TERTO14746 1132 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C8AP07357 584 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CDCP2Q5VXM1 449 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 METRNQ9UJH8 293 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GMPRP36959 345 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KANK3Q6NY19 840 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GLCCI1Q86VQ1 547 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FBXL17Q9UF56 701 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ITGB7P26010 798 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT32Q14532 448 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CRB2Q5IJ48 1285 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DMRTA1Q5VZB9 504 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C11orf87Q6NUJ2 197 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GDF7Q7Z4P5 450 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BMPERQ8N8U9 685 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANKRD33BA6NCL7 494 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DSG3P32926 999 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BORCS6Q96GS4 357 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTLL8A6PVC2 850 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP10-11P60412 298 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLAIN1Q8ND83 568 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT71Q3SY84 523 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CAAP1Q9H8G2 361 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TENM1Q9UKZ4 2725 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ERBB3P21860 1342 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PROB1E7EW31 1015 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNPHO15079 494 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C7P10643 843 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HMGA2P52926 109 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 Q7L0L9 218 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC16A10Q8TF71 515 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SSUH2Q9Y2M2 353 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DCAF8L1A6NGE4 600 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LILRB3O75022 631 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IRAK1P51617 712 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MYT1Q01538 1121 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RING1Q06587 406 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SEMA6BQ9H3T3 888 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADAMTS8Q9UP79 889 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLEKHG5O94827 1062 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT1P04264 644 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CTGFP29279 349 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SEMA3FQ13275 785 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FHL3Q13643 280 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC39A7Q92504 469 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WBP1Q96G27 269 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TENM4Q6N022 2769 aa-0.56□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DBX1A6NMT0 343 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OGFOD2Q6N063 350 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF575Q86XF7 245 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SRRDQ9UH36 339 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADGRE2Q9UHX3 823 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TTC28Q96AY4 2481 aa-0.57□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AZU1P20160 251 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRP8Q14114 963 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IRF7Q92985 503 aa-0.58□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms